私がオリジナルカラーリングで塗装しているガンプラには独自設定があり、

「とある組織が極秘に入手した機体の設計データを元に外見はそのままに、性能を魔改造して向上させた機体で、ベース機を遥かに凌ぐ性能を有する」

というコンセプトで製作しています。具体的にどのような改造がされたかということは、あえて伏せておきますが、ガンプラを作る際には独自の設定を踏まえた上で製作すると更に作品に愛着が持てるのではないかと私は思います。