HG ムラサメ改

武装は、頭部のM2M5DE 12.5mm自動近接防御火器、手持ちライフル型の73式高エネルギービーム砲「ホノイカズヅチ」、72式ビームサーベル「カヤナゴ」、テールスタビレーター基部の73式改攻盾ビーム砲「イワツツノヲ」、フロントスカート内蔵式の71式短距離誘導弾といった更新型に変更され、主翼パイロンへのオプション追加機能も継承されている[16]。

オルドア地区の戦いにおいて、ファウンデーション王国軍親衛隊「ブラックナイツ」による「コンパス」の掃討が行われるなか、ムウ機は右腕を切断されながらも生存し、爆発寸前のアークエンジェル艦内から甲板まで脱出していたマリューを救出し離脱する。

武装
M2M5D 12.5mm自動近接防御火器
同時期の連合製MSにも採用されている近接防御機関砲。頭部に2門、左右の主翼基部に2門ずつの計6門を装備する。口径こそM1アストレイに搭載される「イーゲルシュテルン」の6分の1しかないが、弾芯や装薬の改良によって威力の低下は2分の1に抑えられている。

72式高エネルギービーム砲
背部スタビレーターに1門装備されるビーム砲。機体と同時開発された装備であり、MA形態時の主砲として使用される。出力はビームライフル「イカズチ」とほぼ同等である。MS形態時の使用はできないが、電源が切断され、銃でいう安全装置がかけられた状態になるため、暴発の心配はない[10]。

66A式空対空ミサイル「ハヤテ」
C.E.66年にオーブが制式化した国産空対空ミサイル。ムラサメの場合、左右の腰部フロントアーマーに2門ずつ計4門内装された発射筒に装填されている。MA形態時で特に重宝され、在来航空機などの軽装甲航空目標に対しては絶大な威力を誇る。
『機動戦士ガンダムSEED DESTINY 連合vs.Z.A.F.T.II』ではMS形態でも使用でき、その際はやや山なりに4発発射される。

72式改ビームライフル「イカヅチ」
中距離射撃用のビームライフル。M1アストレイに装備されたものをベースに開発された[7]ムラサメ専用装備であり、MS形態時の主武装として使用されるほか、MA形態時にも固定砲台（マウントラックの可動により、ある程度の射角は確保できる）として使用可能。
MS形態時はトリガーを引くことで作動させるが、MA形態時はマウントを介して発射信号を送り、作動させる。

70J式改 ビームサーベル
左腰部に1本装備されているビームサーベルで、M1アストレイに搭載されていた70式ビームサーベルの改良型。この改良によって整備性・信頼性が向上し、省電力化を図ったことと併せ、70式に比べて30%から40%の駆動時間延伸に成功した。

シールド
対ビームコーティング仕様の防御装備。MA時の機首を兼ねており、内部には着陸脚も収納されている。作戦行動中にこの装備を失った機体はMA形態に変形できず、以後はMS形態のみでの行動に制約される。M1アストレイに装備されたモデルの改良型[7]。

空対地ミサイル「ドラッヘASM」
地球連合軍のMS用飛行オプション装備AQM/E-A4E1 ジェットストライカーに搭載されているものと同様の装備。左右の主翼下に2か所ずつ設けられたハードポイントへ合計4発を装備可能。メサイア攻防戦においても使われた。